Думаю, такая же разница, как и между боевыми ФНами- 1.0 поддерживает форматы 1.0 и 1.05, 1.1- все три. Учитывая, что ФФД 1.1 в природе нет сейчас- для ваших целей на будущее надо брать 1.1. Для тестирования того, что уже есть у вас сейчас, для обучения пользователей- достаточно 1.0.